上海市水利管理事务中心（上海市河湖管理事务中心）前身是上海市水利管理处，于2005年12月，由原市河道（水闸）管理处、原市水利排灌管理处等单位合并成立。2008年6月，与上海市苏州河环境综合整治领导小组办公室合署办公。2017年9月，苏办撤销，增挂“上海市河湖管理事务中心”，人员编制由75人增至80人，并进行了内设部门调整。2021年1月，更名为上海市水利管理事务中心（上海市河湖管理事务中心）。本单位主要承担全市水利、河湖行业管理和市河长办相关事务性工作等主要职责。负责组织和指导全市河湖水环境治理、水利设施管理、农村生活污水治理、水土保持、水利行业精神文明建设等工作。